Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL35Q6PF15 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms