Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6P435 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6P435 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6P435 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6P435 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6P435 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6P435 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6P435 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6P435 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6P435 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6P435 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms