Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNP1Q6NT89 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms