Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRAMD4Q6IC98 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms