Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RALGAPA1Q6GYQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RALGAPA1Q6GYQ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms