Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E7

TXNRD3NB, Protein TXNRD3NB, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3NBQ6F5E7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TXNRD3NBQ6F5E7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD3NBQ6F5E7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNRD3NBQ6F5E7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNRD3NBQ6F5E7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNRD3NBQ6F5E7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNRD3NBQ6F5E7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNRD3NBQ6F5E7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNRD3NBQ6F5E7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms