Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPECC1LQ69YQ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPECC1LQ69YQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPECC1LQ69YQ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms