Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DUPD1Q68J44 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUPD1Q68J44 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms