Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4F1Q66K89 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms