Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM46CQ5VWP2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM46CQ5VWP2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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