Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC7AQ5VTJ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms