Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEF1A1P5Q5VTE0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms