Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C12orf60Q5U649 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms