Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms