Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHYHD1Q5SRE7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms