Protein–RNA interactions for Protein: Q5SGD2

PPM1L, Protein phosphatase 1L, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1LQ5SGD2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1LQ5SGD2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1LQ5SGD2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms