Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGD3Q5JSP0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD3Q5JSP0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD3Q5JSP0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD3Q5JSP0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGD3Q5JSP0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD3Q5JSP0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGD3Q5JSP0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms