Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms