Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLE1Q53GS7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLE1Q53GS7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms