Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP221Q4G0U5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms