Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS9Q3SYG4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BBS9Q3SYG4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms