Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LSM12Q3MHD2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms