Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYT16Q17RD7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT16Q17RD7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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