Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKFB3Q16875 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKFB3Q16875 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKFB3Q16875 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms