Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms