Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM1Q16610 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms