Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNGA3Q16281 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms