Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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