Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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