Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6AP1Q15904 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6AP1Q15904 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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