Protein–RNA interactions for Protein: Q15842

KCNJ8, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 8, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ8Q15842 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNJ8Q15842 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNJ8Q15842 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms