Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85BQ15834 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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