Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIP11Q15643 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms