Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TAF13Q15543 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF13Q15543 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TAF13Q15543 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TAF13Q15543 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF13Q15543 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms