Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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