Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
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