Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP1Q15025 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP1Q15025 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms