Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L3Q14CW9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L3Q14CW9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms