Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF3Q14653 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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