Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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GBX1Q14549 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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GBX1Q14549 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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GBX1Q14549 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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GBX1Q14549 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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GBX1Q14549 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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GBX1Q14549 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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GBX1Q14549 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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GBX1Q14549 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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GBX1Q14549 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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GBX1Q14549 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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GBX1Q14549 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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GBX1Q14549 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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