Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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