Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASGRF1Q13972 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRF1Q13972 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRF1Q13972 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRF1Q13972 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRF1Q13972 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRF1Q13972 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRF1Q13972 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRF1Q13972 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRF1Q13972 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRF1Q13972 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRF1Q13972 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms