Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBFBQ13951 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBFBQ13951 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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