Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP1Q13835 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP1Q13835 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP1Q13835 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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