Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALCAMQ13740 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALCAMQ13740 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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