Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PICALMQ13492 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms