Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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