Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XRCC4Q13426 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XRCC4Q13426 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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