Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMS2P3Q13401 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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