Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP1Q13363 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP1Q13363 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms